海南医学院药物化学学科于2005年被确立为海南省重点（扶持）学科。2010年该学科再次被评为海南省重点（扶持）学科。本学科以海南丰富的热带药用植物（南药黎药）为研究对象，开展药效物质基础研究、产品开发及质量安全与代谢化学研究。
2011年以来，学科获得国家“十二五”科技支撑计划子课题2项、国家自然科学基金4项、海南省和海口市重点科研课题及省自然科学基金二十余项，五年内可支配的科研经费达500余万元人民币；获得授权国家医药发明专利2项；取得海南省科技进步二等奖、三等奖各1项；发表论文141篇，其中SCI、EI、ISTP三大检索源收录论文21篇。
